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“这个声音一定是那个在两年前开发百腕巨人系统的杜兰博士。”小泽还是很认同杜兰的实力的，可惜警视厅没有和杜兰继续合作下去，听说主要原因就是杜兰太能花钱。时隔两年的第一战，假面骑士全胜，蓝色的G3只起到了拖延时间的作用，而百腕巨人更是直接迟到错过了首秀。
新的敌人出现了，并且和古朗基不一样，所以警视厅将新怪人命名为‘UNKNOW’，未知生命体。
而对策组也获得了更多的资金，因为他们发现以两年前未确认生命体数据为蓝本开发的G3系统面对新的敌人是捉襟见肘，所以还是要开发新的更强的战斗系统才行。
而变身新假面骑士的少年是一脸懵逼，因为他是个失忆症患者，根本不记得自己是谁又为什么会变身，他只是听到了脑子里的声音，有一个声音告诉他必须要战斗。至于其他的，少年什么都不知道。